Granty:

Studium polymorfismu kvadruplexů nukleových kyselin

Grantová agentura: GAUK
Identifikační číslo grantu: 388615
Hlavní řešitel: Mgr. Kateřina Mudroňová
Spoluřešitelé: RNDr. Jakub Klener, Ph.D., Doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc., Václav Římal ()

Náplní projektu je studium struktury, topologie a konformačních přechodů guaninových kvadruplexů, biologicky významných čtyřvláknových struktur DNA, a to pomocí Ramanovy spektroskopie. Zabýváme se zejména konformačním polymorfizmem telomerních sekvencí různých organizmů podmíněného vysokými koncentracemi DNA, kde Ramanova spektroskopie představuje zvlášť užitečnou a přínosnou, i když zatím poměrně málo využívanou experimentální metodu. Bude studován vliv různých fyzikálně-chemických faktorů na vznik, strukturu a termální stabilitu guaninových kvadruplexů, a to systematicky od úrovně guaninových tetrád tvořených mononukleotidy. Dalším zdrojem informací budou absorpční a CD spektra a metody gelové elektroforeze. V rámci projektu bude provedena modernizace Ramanova spektrometru umožňující automatizaci časově náročných měření.