Granty:

Regulační úseky nukleových kyselin - polymorfismus, dynamika a interakce

Grantová agentura: GAČR
Identifikační číslo grantu: 15-06785S
Hlavní řešitel: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

Projekt je zaměřený na detailní studium strukturního uspořádání, tvorby biologicky relevantních komplexů a dynamiky vybraných reprezentativních typů regulačních úseků nukleových kyselin - DNA guaninových kvadruplexů, sekvencí miRNA a DNA transkripčních elementů obsahujících CArG box - pro objasnění molekulárního mechanismu jejich regulační funkce a jejího ovlivňování externími faktory, jmenovitě molekulárním crowdingem, teplotou a molekulárním okolím zabezpečujícím nábojovou kompenzaci. Úseky nukleových kyselin, případně jejich komplexy s klíčovými proteiny, budou studovány metodami SPR biosenzoru, Ramanovy a NMR spektroskopie, CD spektroskopie, Ramanovy optické aktivity a molekulárně-dynamických simulací.