Granty:

Nové DNA a RNA oligonukleotidy s fosfonothioátovými a fosfonoamidátovými internukleotidovými vazbami

Grantová agentura: GAČR
Identifikační číslo grantu: 13-26526S
Hlavní řešitel: Ing. Ivan Rosenberg, CSc. (Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.)

Projekt je zameren na syntézu strukturne diverzifikovaných izopolárních analogu oligonukleotidu (ON) s nukleázove stabilní internukleotidovou vazbou fosfonátového typu jako možných (i) nástroju k ovlivnení exprese genomu (antisensní ON a siRNA), (ii) agonistu/antagonistu receptoru TLR9 (ON s CpG motivem) a (iii) efektoru tzv. 2-5A dráhy - agonistu/antagonistu RNasy L (2', 5'-oligoriboadenyláty) a inhibitoru 2',5'-specifické fosfodiesterasy. Zásadní soucástí projektu je syntéza monomeru – nukleosid- 2'(3')- a 5'-fosfonátu/fosfinátu, jejichž inkorporace do DNA a RNA oligomeru, vede ke vzniku izosterních a neizosterních fosfonothioátových, fosfonoamidátových a fosfonothioamidátových internukleotidových vazeb, které nebyly dosud v ON studovány. Úcinky pripravených ON budou testovány in vitro na rekombinantních enzymech, tkánových kulturách a na zvírecích modelech. Interakce ON budou studovány na molekulární úrovni spektrálními a teoretickými metodami a nové poznatky budou korelovány s biologickou aktivitou nových ON s cílem vedet více o vztazích mezi strukturou a biologickou aktivitou.