Strukturní markery amidové a disulfidové skupiny ve spektrech Ramanovy optické aktivity
Grantová agentura: GAUK
Identifikační číslo grantu: 578212
Hlavní řešitel: Mgr. Markéta Pazderková
Annotace grantu
Budeme studovat charakteristický projev amidových a disulfidových skupin
v roztocích molekul peptidů a proteinů pomocí Ramanovy optické aktivity
(ROA) a dalších chiroptických metod jako například elektronového
cirkulárního dichroismu (ECD). Navážeme na dlouholetou tradici
fyzikálního studia biomolekul na Fyzikálním ústavu MFF UK a využijeme
zde zkonstruovaný unikátní přístroj pro měření ROA. Pomocí ROA chceme
nalézt informace o strukturních detailech amidových a disulfidových
skupin, nedostupné pomocí jiných spektroskopických technik.
Projekt je navrhován jako dvouletý s předpokládaným ukončením k 31. 12.
2013. V roce 2012 budeme pokračovat v interpretaci již získaných spekter
látek obsahujících amidové vazby (spirodilaktamy) a ve studiu interakcí
disulfidových můstků v krátkých peptidech (neurohypofyzárních hormonech,
popř. antimikrobiálních peptidech obsahujících jednu nebo dvě
disulfidové vazby). V druhém roce předpokládáme rozšíření dané
problematiky na flexibilnější systémy (např. krátké proteiny) a větší
uplatnění teoretických metod.
