Granty:

Studium strukturních a vazebných vlastností TRPM kanálů

Grantová agentura: GAČR
Identifikační číslo grantu: 17-04236S
Hlavní řešitel: Ing. Jan Teisinger, CSc (Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.)
Spoluřešitelé: RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.

TRP kanály jsou celulární sensory regulované širokým spektrem fyzikálních a chemických stimulů. Mají rovněž úlohu v buněčné regulaci, kdy odpovídají na environmentální podněty a vykazují polymodální vlastnosti. Fosfatidyl- inositol- 4,5- bisfosfát (PIP2) je intracelulární messenger, jehož interakce s proteiny ovlivňují signalizační dráhy. Procesy otevírání a zavírání TRP kanálů jsou regulovány interakcí s PIP2. Identifikace a funkční význam vazebných míst pro PIP2 na intracelulárních koncích N- a C- TRPM kanálů bude předmětem tohoto projektu. Série fúzních proteinů různých délek a mutací na N-a C- koncích kanálů budou využity k charakterizaci vazebných míst pro PIP2 pomocí spektroskopických metod. Data budou korelována s výsledky získanými elektrofysiologickými měřeními, kdy TRPM kanály a jejich mutované formy s PIP2 doménami budou exprimovány v HEK 293 buňkách. Budou vytvořeny homologní modely TRPM kanálů na základě známých struktur TRPV1, TRPV2 a TRPA1 kanálů a prostřednictvím molekulárně dynamických simulací bude zkoumána jejich interakce s PIP2.