Studium dynamiky proteinů pomocí optické spektroskopie

Autor: Bc. Tomáš Pazderka
Vedoucí práce: RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.
Konzultanti:
Typ: Magisterská

Abstrakt: V rámci diplomové práce byl vytvořen a otestován software pro dvoudimenzionální korelační spektroskopii (2DKoS). Na modelových případech byly otestovány jednotlivé možné jevy v 2DKoS analýze vibračního cirkulárního dichroismu. Pro účely praktické aplikace 2DKoS byly změřeny teplotní a časové závislosti Ramanových spekter a spekter Ramanovy optické aktivity proteinu lysozymu. Fibrilace a teplotní denaturace lysozymu byla analyzována pomocí 2DKoS a faktorové analýzy (FA). Druhým studovaným systémem byly proteiny NKR-P1A a NKR-P1C, jejich teplotní dynamika byla monitorována pomocí infračervené spektroskopie s Fourierovou transformací a Ramanovy spektroskopie. Pomocí 2DKoS se podařilo charakterizovat dynamické chování všech studovaných proteinů.

Klíčová slova: Dvoudimenzionální korelační spektroskopie, Ramanova optická aktivita, Lysozym, Ramanova spektroskopie, Infračervená spektroskopie, protein NKR-P1