Studium strukturního polymorfismu mononukleotidových guaninových kvadruplexů metodami optické spektroskopie

Anotace: Guaninové kvadruplexy (G4) jsou nekanonické sekundární struktury nukleových kyselin, které monou za vhodných podmínek vznikat v částech DNA a RNA bohatých na guanin. V závislosti na počtu vláken tvořících kvadruplex, jejich orientaci a sekvenci rozlišujeme celou řadu konformačně a strukturně odlišných typů kvadruplexů. Za vysoké koncentrace mohou obdobné struktury - tzv. mononukleotidové guaninové kvadruplexy (mG4) - vznikat i samoasociací samotných volných guaninových mononukleotidů. G4 jsou v současné době intenzivně studovány, neboť nedávné studie poukázaly na jejich regulační funkci (nacházejí se v promotorových sekvencích některých genů) a také možnou protinádorovou funkci. Náplní magisterské práce bude experimentální studium vzniku, struktury a stability mG4 pomocí metod optické spektroskopie. Cílem práce bude stanovení konformačních značek (markerů) pro různé typy kvadruplexů a charakterizace rozdílů ve struktuře kvadruplexů způsobených různými fyzikálně chemickými podminkami. Práce je s přístrojově, metodicky a materiálově zajištěna.