Studium vlivu deuterace na strukturu a stabilitu mononukleotidových G-kvadruplexů

Anotace: Guaninové kvadruplexy (G4) jsou nekanonické sekundární struktury nukleových kyselin, které mohou za vhodných podmínek vznikat v částech DNA a RNA bohatých na guanin. V závislosti na počtu vláken tvořících kvadruplex, jejich orientaci a sekvenci rozlišujeme celou řadu konformačně a strukturně odlišných typů kvadruplexů. Za vysoké koncentrace mohou obdobné struktury - tzv. mononukleotidové guaninové kvadruplexy (mG4) - vznikat i samoasociací samotných volných guaninových mononukleotidů. G4 jsou v současné době intenzivně studovány, neboť nedávné studie poukázaly na jejich regulační funkci (nacházejí se v promotorových sekvencích některých genů) a také možnou protinádorovou funkci. Náplní bakalářské práce bude experimentální studium mG4 pomocí metod optické spektroskopie v prostředí těžké vody, kdy může docházek k vodík-deuteriové výměně na samotných studovaných molekulách. Cílem práce bude charakterizace změn, které tato výměna způsobuje ve struktuře a stabilitě mG4 komplexů a stanovení příslušných konformačních značek (markerů). Práce je s přístrojově, metodicky a materiálově zajištěna.