Studium hybridizačních vlastností modifikovaných oligonukleotidů s potenciální terapeutickou aplikací, pomocí spektroskopických metod
Autor: RNDr. Martin Kříž, Ph.D.Vedoucí práce: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.
Konzultanti:
Typ: Magisterská
Abstrakt: Diplomová práce představuje pokračování výzkumu nových typů modifikovaných nukleotidů – potenciálních kandidátů pro "antisensní" terapii. Je věnována analogům nukleotidů, ve kterých je ribososfátová část molekuly nahrazena pyrolidinfosfonátem. Kromě Ramanovy spektroskopie byla využita i elektronová absorpční spektroskopie a okrajově i fluorescenční spektroskopie. Bylo zjištěno, že studované látky mají neočekávané spektroskopické vlastnosti, které se projevují specifickým fluorescenčním pozadím a atypickým spektrem Ramanova rozptylu. Série opakovaných pokusů s přečišťováním vzorků a spektroskopickým měřením za různých podmínek ukázala, že se jedná o vliv příměsi, která kromě fluorescenčního pozadí s maximem na měřeném spektrálním úseku Stokesova Ramanova rozptylu přispívá i rezonančně zesíleným Ramanovým signálem. Příměs se ze vzorků nepodařilo ani opakovaným čištěním zcela odstranit a její množství ve vzorku u jednotlivých šarží vzorků značně kolísalo. Z výsledků práce vyplývá, že příměs vzniká ze samotného vzorku fotochemickým působením světla za aerobních podmínek a jedná se o kombinaci minimálně dvou látek. Produkci příměsi podporuje zvýšená teplota, na druhé straně lze vyvolat i její fotodegradaci. Za použití metod faktorové analýzy byla určena pH závislost Ramanova rozptylu analogů 3’–deoxythymidinu. Byly zjištěny dva acidobazické přechody interpretované jako přechod mezi neutrální molekulou a obojetným iontem a jako deprotonace na thyminu. Byla izolována spektra Ramanova rozptylu příslušných tří forem daných analogů a provedena jejich interpretace.
Klíčová slova: None