Studium molekulárních komplexů nukleosidů, nukleotidů a krátkých oligonukleotidů s kationickými metaloporfyriny

Autor: Mgr. Vít Marek
Vedoucí práce: Doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc.
Konzultanti:
Typ: Magisterská

Abstrakt: Pomocí absorpční spektrofotometrické titrace a nsTRRS byly studovány interakce kationického měďnatého porfyrinu (CuT4) s jednořetězcovými deoxyoligoadenyláty a deoxyoligothymidyláty různé délky, a s krátkými vlásenkami obsahujícími jednovláknová očka sestávající z uvedených oligonukleotidů. Naměřená data byla zpracována metodami vícerozměrné statistické analýzy a globálními fity. Výsledky ukazují, že vazba CuT4 na oligo(dT)n a oligo(dA)n nabývá s jejich rostoucí délkou odlišný charakter. Zatímco u oligo(dT)n lze s rostoucí délkou pozorovat kooperativní přechod mezi interkalací a externí vazbou, pro oligo(dA)n je tento přechod pozvolný. Podobně, zatímco v případě vlásenek byl pozorován silný vliv zkracujícího se T-očka na vzrůst afnity CuT4 k externí vazbě, u A-očka podobný efekt pozorován nebyl.

Klíčová slova: None