Interakce antimikrobiálních peptidů a jejich analogů s modely buněčných membrán
Autor: Bc. Pavel SoučekVedoucí práce: RNDr. Eva Kočišová, PhD.
Konzultanti: Mgr. Markéta Pazderková, RNDr. Lucie Bednárová, CSc., Prof. RNDr. Marek Procházka, Dr.
Typ: Magisterská
Anotace: Vzhledem ke stále rostoucí rezistenci bakterií vůči antibiotikům vzniká bezprostřední nutnost vývoje nové třídy nerezistentních léčiv. Vhodným kandidátem mohou být antimikrobiální peptidy (AMP), jedna z forem chemické obrany organismů proti bakteriím, houbám atp. Jde o strukturně heterogenní krátké peptidy obsahující od 5 do ca. 40 aminokyselin, které v kontaktu s buněčnou membránou mění svou strukturu (např. z náhodného klubka na alfa-helix) a specifickou interakcí postupně tuto membránu rozrušují. Detaily mechanizmu jejich účinku nejsou zcela známy a jsou předmětem řady studií. Náplní diplomové práce by měla být spektroskopická studie vybraných AMP v interakci s různými typy modelových membrán za různých fyzikálně-chemických podmínek pomocí vibrační spektroskopie (infračervená a Ramanova spektroskopie), vibrační optické aktivity (vibrační cirkulární dichroismus, Ramanova optická aktivita) a elektronového cirkulárního dichroismu. Měření budou probíhat ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie AV ČR.