Nové přístupy ke studiu struktury proteinu pomocí vibrační spektroskopie
Grantová agentura: GAAV
Identifikační číslo grantu: KJB101120805
Hlavní řešitel: RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.
Spoluřešitelé:
RNDr. Kateřina Hofbauerová, PhD.
Annotace grantu
Určení struktury proteinů představuje jednu z klíčových úloh současné
molekulární biologie. Je zde naléhavá potřeba třídimenzionálních
struktur proteinů pro pochopení jejich role v organizmech a pro
efektivní návrh léčiv. Hlavním cílem projektu je vývoj nové metodiky pro
stanovení obsahu sekundárních struktur proteinů pomocí vibrační
spektroskopie (Ramanova spektroskopie, Ramanova optická aktivita,
Ramanova spektroskopie kapkově nanášených povlaků, Fourierova
infračervená spektroskopie, Fourierova infračervená spektroskopie se
zeslabenou totální reflexí). Pro každou metodu bude změřena nová
rozsáhlá spektrální referenční sada, budou implementovány stávají metody
a nové metody (založené na multivariační statistice) s vyšším
informačním obsahem, např. určením počtu strukturních segmentů, či
sbalení atd. Vyvinuté metody budou volně k dispozici a mohou být
aplikovány v dalším proteinovém výzkumu.