Studium polymorfismu kvadruplexů nukleových kyselin
Grantová agentura: GAUK
Identifikační číslo grantu: 388615
Hlavní řešitel: Mgr. Kateřina Mudroňová
Spoluřešitelé:
RNDr. Jakub Klener, Ph.D.,
Doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc.,
Václav Římal ()
Annotace grantu
Náplní projektu je studium struktury, topologie a konformačních přechodů
guaninových kvadruplexů, biologicky významných čtyřvláknových struktur
DNA, a to pomocí Ramanovy spektroskopie. Zabýváme se zejména
konformačním polymorfizmem telomerních sekvencí různých organizmů
podmíněného vysokými koncentracemi DNA, kde Ramanova spektroskopie
představuje zvlášť užitečnou a přínosnou, i když zatím poměrně málo
využívanou experimentální metodu. Bude studován vliv různých
fyzikálně-chemických faktorů na vznik, strukturu a termální stabilitu
guaninových kvadruplexů, a to systematicky od úrovně guaninových tetrád
tvořených mononukleotidy. Dalším zdrojem informací budou absorpční a CD
spektra a metody gelové elektroforeze. V rámci projektu bude provedena
modernizace Ramanova spektrometru umožňující automatizaci časově
náročných měření.