Theses defended in year 2009:

Master

• Mgr. Markéta Kubáňová: Raman optical activity and conformation of structurally important groups in peptides and proteins
  Advisor: Prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc.

• Mgr. Pavla Pečínková (roz. Ottová): Thermodynamic Stability of Hybrid Nucleic Acid Complexes: Microcalorimetric Study
  Advisor: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

• Bc. Tomáš Pazderka: Protein dynamics studied by means of optical spectroscopy
  Advisor: RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.

• Mgr. Jana Hrudíková: Ramanova optická aktivita a konformační flexibilita peptidů v roztoku
  Advisor: Prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc.

• Mgr. Barbora Profantová (roz. Řezáčová), Ph.D.: Structural flexibility of regulatory DNA element
  Advisor: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

• Mgr. Petra Šimáková: Study of biomolecules by surface-enhanced Raman microspectroscopy
  Advisor: Prof. RNDr. Marek Procházka, Dr.

• Mgr. Vlastimil Zíma: Molecular dynamics simulations of complexes consisting of proteins and nucleic acids
  Advisor: RNDr. Ivan Barvík Jr., PhD.

• Tomas Bartek: detail Molekulárně-dynamické simulace komplexů nukleových kyselin enzymu RNase H
  Advisor: RNDr. Ivan Barvík Jr., PhD.

Bachelor

• Jindřich Soukup: Molekulárně-dynamické simulace proteinových struktur
  Advisor: RNDr. Ivan Barvík Jr., PhD.

• RNDr. Jakub Klener, Ph.D.: Functional study of prokaryotic homologs of Nramp transport proteins
  Advisor: R Chaloupka