RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.
tajemník ústavu
Narozen: 8. října 1974, Praha
E-mail: kopecky@karlov.mff.cuni.cz
- Pracoviště: Fyzikální ústav UK, Ke Karlovu 5
- Místnost: F 184, 1. suterén
- Telefon: +420 221 911 472
- Fax: +420 224 922 797
Odborné zájmy:
- Využití optické spektroskopie v biofyzice (Ramanova spektroskopie a mikroskopie, Ramanova optická aktivita, infračervená spektroskopie, UV-VIS spektroskopie, cirkulární dichroismus).
- Studium struktury proteinů a jejich interakcí s ligandy či nukleovými kyselinami pomocí metod optické spektroskopie.
- Studium sacharidů a glykoproteinů pomocí pomocí metod vibrační spektroskopie.
- Aplikace vibrační spektroskopie v medicínské diagnostice.
- Kalorimetrie proteinů.
- Počítačové modelování proteinů a jejich interakcí s ligandy.
- Užití metod multidimenzionální statistiky v optické spektroskopii.
- Studium struktury a fyzikálně–chemických vlastností modifikovaných nukleotidů pomocí metod optické spektroskopie.
- Kvantově–mechanické výpočty nukleotidů a jejich modifikací pomocí programů Gaussian .
- Programování v prostředí MATLAB .
- Autor a spoluautor 22 článků v impaktovaných časopisech, 84 konferenčních příspěvků (včetně 7 přednášek, 4 zvaných přednášek a jedné plenární přednášky), více než 200 popularizačních článků
- Spolueditor sborníku evropské konference 9th European Conference on the Spectroscopy of Biological Molecules.
- Šéfredaktor populárně-naučného časopisu, popularizujícího převážně astronomii a astrofyziku, Astropis .
Odborný životopis:
- Cena v soutěži Spektroskopické společnosti Jana Marca Marci za nejlepší diplomovou práci v oblasti spektroskopie za rok 1998.
- Cena rektora Univerzity Karlovy podporovaná deníkem Mladá Fronta Dnes udělená při příležitosti zakončení oslav 650. výročí Univerzity v roce 1999 za zcela mimořádné studijní a vědecké výsledky.
- Cena Nadačního fondu Bernarda Bolzana za nejlepší vědeckou práci ve fyzice za rok 2003.
- Cena v soutěži Spektroskopické společnosti Jana Marca Marci za nejlepší původní publikovanou práci v oblasti spektroskopie za rok 2004.
2004‐ | Odborný asistent, Fyzikální ústav Univerzity Karlovy v Praze |
2002‐2004 | Vědecký pracovník, Fyzikální ústav Univerzity Karlovy v Praze; Vědecký pracovník, Katedra biochemie Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy v Praze . |
1999‐03 | Vědecký pracovník, Fyziologický ústav Akademie věd České republiky . |
1998‐04 | Ph.D., Biofyzika, chemická a makromolekulární fyzika, Matematicko–fyzikální fakulta University Karlovy. |
1997 | Účast na 6. ročníku mezinárodní letní školy “Summer School on Vibrational Spectroscopy in Biophysics and Biochemistry” pořádané Fyzikálním ústavem Karlovy University v Praze. |
1993‐98 | Mgr., Fyzika molekulárních a biologických systémů, Matematicko–fyzikální fakulta University Karlovy. Diplomová práce na téma: “Studium strukturních a fyzikálně–chemických vlastností nových acyklických analogů nukleotidů – potenciálních terminátorů virové DNA transkripce”. |
1989‐93 | Studium na pražském gymnáziu Nad alejí zakončené v roce 1993 maturitou s vyznamenáním. |
Obhájené práce:
- Dizertační práce: Structural and Physico–Chemical Properties of Nucleotide and Other Bioactive Compounds in Interaction with Proteins