Obhájená dizertační práce:

2021

• RNDr. Jakub Klener, Ph.D.: Studium struktury a interakcí nukleových kyselin pomocí rezonančního Ramanova rozptylu
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

2018

• Mgr. Tomáš Pazderka: Studium struktury proteinů pomocí optické spektroskopie
  Vedoucí: RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.

• Mgr. Vlastimil Zíma: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z proteinů a nukleových kyselin
  Vedoucí: RNDr. Ivan Barvík Jr., PhD.

2017

• RNDr. Václav Profant: Struktura a dynamika peptidů a proteinů v roztoku: aplikace Ramanovy optické aktivity
  Vedoucí: Prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc.

• Mgr. Petra Šimáková: Povrchem zesílená Ramanova mikrospektroskopie biomolekul a biologických systémů
  Vedoucí: Prof. RNDr. Marek Procházka, Dr.

• Mgr. Vlastimil Peksa: Vývoj a testování nových kovových nanosubstrátů pro biomolekulární senzory založené na spektroskopii povrchem zesíleného Ramanova rozptylu (SERS)
  Vedoucí: Prof. RNDr. Marek Procházka, Dr.

2015

• Mgr. Markéta Pazderková: Ramanova optická aktivita biomolekul: od jednoduchých modelů ke komplexním systémům
  Vedoucí: Prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc.

• RNDr. Tomáš Špringer, Ph.D.: In situ study of nuclear acids interactions key for gene expression and therapy based on its silencing
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

2014

• Mgr. Barbora Profantová (roz. Řezáčová), Ph.D.: Molecular mechanism of DNA regulatory segment recognition by MADS box family transcription factors
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

2013

• RNDr. Martin Kříž, Ph.D.: Spektroskopické studium klíčových biomolekulárních interakcí pro terapeutické aplikace modifikovaných oligonukleotidů
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

• Mgr. Kamil Maláč: Počítačové modelování biomolekul - potenciálních chemoterapeutik
  Vedoucí: RNDr. Ivan Barvík Jr., PhD.

2012

• Mgr. Natália Šmídová: Optimalizace spektroskopie povrchem zesíleného Ramanova rozptylu ke studiu biologicky významných molekul a jejich interakcí
  Vedoucí: Prof. RNDr. Marek Procházka, Dr.

2011

• Ing. Shirly Josefina Espinoza Herrera, PhD.: Function of Magnesium Ions in the Formation of Biologically-Active Nucleic Acids Structures
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

2006

• RNDr. Hana Lísalová (roz. Vaisocherová), Ph.D.: Monitoring of Biomolecular Interactions for Nucleic Acids Research
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

• Mgr. Josef Kapitán, Ph.D.: Teoretický a experimentální rozvoj Ramanovy optické aktivity jako metody studia biomolekul ve vodním prostředí
  Vedoucí: Prof. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc.

2005

• RNDr. Daniel Němeček, PhD.: A New Generation of Synthetic Oligonucleotide Analogs Usable in Antisense Strategy: Hybridization Properties and Stability of Complexes Formed with Their Natural DNA Counterparts
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

• RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D.: MR Investigations of Host– Guest Complexes and Their Dynamic Properties
  Vedoucí: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc.

2004

• RNDr. Vladimír Kopecký Jr., PhD.: Structural and Physico–Chemical Properties of Nucleotide and Other Bioactive Compounds in Interaction with Proteins
  Vedoucí: Doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc.