Studenti:

• Bc. Martin Škorňa
  3. rok Mgr. studia
  Magisterská práce: Molekulárně-dynamické simulace komplexů proteinů a nukleových kyselin

Bývalí studenti:

• Tomas Bartek
  2009 - Magisterská práce: detail Molekulárně-dynamické simulace komplexů nukleových kyselin enzymu RNase H

• Radim Cajzl
  2015 - Bakalářská práce: Molekulárně-dynamické simulace muskarinového receptoru

• Bc. Lukáš Charamza
  2014 - Magisterská práce: Molecular Dynamics Simulations of Membrane Proteins

• Mgr. Jakub Dostál
  2006 - Bakalářská práce: Molekulárně–dynamické simulace analog nukleových kyselin.

• Bc. Robert Goldwein
  2011 - Magisterská práce: Molekulárně-dynamické simulace biomolekul

• Mgr. Jiří Hammer
  2008 - Magisterská práce: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z nukleových kyselin a proteinů

• Bc. Martin Hanák
  2021 - Magisterská práce: Výpočty volné energie prostřednictvím MD simulací

• Mgr. Kamil Maláč
  2013 - Dizertační práce: Počítačové modelování biomolekul - potenciálních chemoterapeutik
  2004 - Magisterská práce: Počítačové modelování struktury potenciálních chemoterapeutik a jejich komplexů s nukleovými kyselinami

• Josef Melcr
  2011 - Bakalářská práce: Molekulárně-dynamické simulace biomolekul - komplexů sestávajících z proteinů a nukleových kyselin
  2013 - Magisterská práce: QM/MM výpočty a klasické molekulárně-dynamické simulace biomolekul

• Ján Naništa
  2012 - Bakalářská práce: Molekulárně-dynamické simulace biomolekul

• Bc. Ricky Nencini
  2016 - Magisterská práce: Počítačové modelování membránových proteinů

• Patrik Ohnout
  2019 - Bakalářská práce: Počítačové modelování enzymu CRISPR-Cas9

• Mgr. Diana Pavlová
  2007 - Magisterská práce: Molekulárně–dynamické simulace analog nukleových kyselin

• Michal Ronovský
  2016 - Bakalářská práce: Počítačové modelování komplexů chemicky modifikovaných nukleových kyselin a virových polymeráz

• Bc. Pavol Šimko
  2022 - Magisterská práce: Počítačové modelování membránových proteinů

• Daniel Šmít
  2008 - Bakalářská práce: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z nukleových kyselin a proteinů

• Mgr. Saralamba Sompomb
  2006 - Magisterská práce: Molekulárně–dynamické simulace komplexů HIV reverzní transkriptázy a jejích potenciálních inhibitorů

• Jindřich Soukup
  2009 - Bakalářská práce: Molekulárně-dynamické simulace proteinových struktur

• Bc. David Španěl
  2013 - Bakalářská práce: Molekulárně-dynamické simulace membránových proteinů
  2013 - Magisterská práce: Počítačové modelování adenosinového receptoru

• Mgr. Vlastimil Zíma
  2007 - Bakalářská práce: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z nukleových kyselin a proteinů
  2009 - Magisterská práce: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z proteinů a nukleových kyselin
  2018 - Dizertační práce: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z proteinů a nukleových kyselin