Students:

• Bc. Martin Škorňa
  3rd year of Mgr. study
  Master thesis: Molekulárně-dynamické simulace komplexů proteinů a nukleových kyselin

Finished students:

• Tomas Bartek
  2009 - Master thesis: detail Molekulárně-dynamické simulace komplexů nukleových kyselin enzymu RNase H

• Radim Cajzl
  2015 - Bachelor thesis: Molekulárně-dynamické simulace muskarinového receptoru

• Bc. Lukáš Charamza
  2014 - Master thesis: Molecular Dynamics Simulations of Membrane Proteins

• Mgr. Jakub Dostál
  2006 - Bachelor thesis: Molekulárně–dynamické simulace analog nukleových kyselin.

• Bc. Robert Goldwein
  2011 - Master thesis: Molekulárně-dynamické simulace biomolekul

• Mgr. Jiří Hammer
  2008 - Master thesis: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z nukleových kyselin a proteinů

• Bc. Martin Hanák
  2021 - Master thesis: Výpočty volné energie prostřednictvím MD simulací

• Mgr. Kamil Maláč
  2013 - Doctoral thesis: Počítačové modelování biomolekul - potenciálních chemoterapeutik
  2004 - Master thesis: Počítačové modelování struktury potenciálních chemoterapeutik a jejich komplexů s nukleovými kyselinami

• Josef Melcr
  2011 - Bachelor thesis: Molecular dynamics simulations of biomolecular complexes consisting of proteins and nucleic acids
  2013 - Master thesis: QM/MM výpočty a klasické molekulárně-dynamické simulace biomolekul

• Ján Naništa
  2012 - Bachelor thesis: Molecular dynamics simulations of biomolecules

• Bc. Ricky Nencini
  2016 - Master thesis: Computational Modeling of Membrane Proteins

• Patrik Ohnout
  2019 - Bachelor thesis: Počítačové modelování enzymu CRISPR-Cas9

• Mgr. Diana Pavlová
  2007 - Master thesis: Molekulárně–dynamické simulace analog nukleových kyselin

• Michal Ronovský
  2016 - Bachelor thesis: Počítačové modelování komplexů chemicky modifikovaných nukleových kyselin a virových polymeráz

• Bc. Pavol Šimko
  2022 - Master thesis: Computational Modeling of Membrane Proteins

• Daniel Šmít
  2008 - Bachelor thesis: Molekulárně–dynamické simulace komplexů sestávajících z nukleových kyselin a proteinů

• Mgr. Saralamba Sompomb
  2006 - Master thesis: Molekulárně–dynamické simulace komplexů HIV reverzní transkriptázy a jejích potenciálních inhibitorů

• Jindřich Soukup
  2009 - Bachelor thesis: Molekulárně-dynamické simulace proteinových struktur

• Bc. David Španěl
  2013 - Bachelor thesis: Molekulárně-dynamické simulace membránových proteinů
  2013 - Master thesis: Počítačové modelování adenosinového receptoru

• Mgr. Vlastimil Zíma
  2007 - Bachelor thesis: Molecular dynamics simulations of complexes consisting of proteins and nucleic acids
  2009 - Master thesis: Molecular dynamics simulations of complexes consisting of proteins and nucleic acids
  2018 - Doctoral thesis: Molecular dynamics simulations of complexes consisting of proteins and nucleic acids